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采用VMD按照某一坐標(biāo)軸旋轉(zhuǎn)坐標(biāo)結(jié)構(gòu)

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選擇所有原子,并記為 a l l all all

 set all [atomselect top all]


繞著z軸旋轉(zhuǎn)90

 $all move [transaxis z -90]

1. 旋轉(zhuǎn)前

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2. 繞著Y軸旋轉(zhuǎn)30° 旋轉(zhuǎn)后

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3. 調(diào)整盒子大小

measure minmax $all

$all moveby {1.5506435602219426e-6 1.8080943391396431e-6 8.952644634518947e-7}

measure minmax $all

pbc set {123.67752075195313 142.7479705810547 71.4052505493164}

采用VMD按照某一坐標(biāo)軸旋轉(zhuǎn)坐標(biāo)結(jié)構(gòu),LAMMPS小技巧,VMD,旋轉(zhuǎn)坐標(biāo),分子模擬文章來源地址http://www.zghlxwxcb.cn/news/detail-534557.html

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