前言
AlphaFold 2，是DeepMind公司的一個(gè)人工智能程序。2020年11月30日，該人工智能程序在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)大賽CASP 14中，對(duì)大部分蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)與真實(shí)結(jié)構(gòu)只差一個(gè)原子的寬度，達(dá)到了人類利用冷凍電子顯微鏡等復(fù)雜儀器觀察預(yù)測(cè)的水平，這是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)史無(wú)前例的巨大進(jìn)步。這一重大成果雖然沒有引起媒體和廣大民眾的關(guān)注，但生物領(lǐng)域的科學(xué)家反應(yīng)強(qiáng)烈。
目前，AlphaFold2的源代碼已經(jīng)在GitHub上公開，而且現(xiàn)在科學(xué)家正在利用AlphaFold2對(duì)已有的蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行高通量的預(yù)測(cè)，建立了一些模式生物物種所有蛋白的AlphaFold2預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)（https://alphafold.ebi.ac.uk/）。
可以看到，雖然利用AlphaFold2預(yù)測(cè)了這么多生物的數(shù)據(jù)庫(kù)，但是并未覆蓋所有的蛋白序列數(shù)據(jù)庫(kù)，所以只有搭建本地的AlphaFold2服務(wù)，你才能用AlphaFold2隨心所欲的預(yù)測(cè)自己研究蛋白的結(jié)構(gòu)。
接下來(lái)將給大家介紹AlphaFold2的使用方法，在北鯤云上免安裝使用。對(duì)于沒有Linux基礎(chǔ)或本地硬件配置不足的人，僅需1分鐘即可成功提交蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)任務(wù)，能夠省去很多麻煩。
二、在北鯤云使用AlphaFold2進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
- 選擇AlphaFold2
在“應(yīng)用中心”搜索AlphaFold2軟件并選中，在右側(cè)彈出的軟件詳情欄中點(diǎn)擊“提交作業(yè)”。
img文章來(lái)源地址http://www.zghlxwxcb.cn/news/detail-790468.html
- 選擇可視化模板提交
推薦選擇可視化“模板提交”的方式提交作業(yè)，平臺(tái)已為AlphaFold2內(nèi)置了幾個(gè)可視化模板，按要求填寫相應(yīng)參數(shù)即可提交預(yù)測(cè)任務(wù)。文章來(lái)源：http://www.zghlxwxcb.cn/news/detail-790468.html
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- 填寫模板參數(shù)，選擇硬件配置
到了這里，關(guān)于使用AlphaFold2進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的文章就介紹完了。如果您還想了解更多內(nèi)容，請(qǐng)?jiān)谟疑辖撬阉鱐OY模板網(wǎng)以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章，希望大家以后多多支持TOY模板網(wǎng)！
