直接代碼版本
#Linux中如何退出r的幫助文檔
要退出幫助文檔，請按"q"鍵，即按下小寫字母"q"鍵
#########解壓命令
tar xvf FileName.tar
tar zxvf FileName.tar.gz #z不可隨便亂加
gunzip FileName.gz
gzip -d FileName.gz
tar zxvf FileName.tar.gz
tar jxvf FileName.tar.bz2
tar jxvf FileName.tar.bz
tar Zxvf FileName.tar.Z
bzip2 -d FileName.bz2
bunzip2 FileName.bz2
bzip2 -d FileName.bz
unzip FileName.zip
uncompress FileName.Z
rar x FileName.rar
rpm2cpio FileName.rpm | cpio -div
rar p FileName.deb data.tar.gz | tar zxf -詳細(xì)版本
在Linux的默認(rèn)的版本中不是所有的命令都有，但是基本的命令是都有的，但是有一下不常用的命令是沒有，在沒有什么情況，那么就需要通過的自己來進(jìn)行安裝所需要的命令，可以通過的是yum來安裝所需的命令。
1、在進(jìn)行使用Linux來嘗試進(jìn)行解壓的一個(gè)tar的文件，那么就需要找到為tar的壓縮包的文件。
2、然后命令中輸入為：tar 文件名.tar，然后直接回車即可，提示沒有tar的命令。
3、沒有這個(gè)tar的命令是可以通過yum的方法來機(jī)型安裝，直接輸入yum -y install tar
4、解壓tar的文件需要有一些命令的，所以可以通過幫助的方法來解壓文件，獲取tar的幫助，直接輸入tar --help即可。
5、然后到需要的解壓的所在的目錄下，進(jìn)行輸入該命令即可，tar -xf test.tar?
6、可以看到的是文件被解壓成功了，可以使用該文件來進(jìn)行操作了。
?Linux系統(tǒng)中tar壓縮包怎么解壓?_LINUX_操作系統(tǒng)_腳本之家 (jb51.net)
Linux下批量解壓 csv.gz
gunzip *.gz，按回車
Linux下記數(shù)Linux 計(jì)數(shù)命令 WC
?(971條消息) Linux 計(jì)數(shù)命令 WC_HelloWorld搬運(yùn)工的博客-CSDN博客_linux統(tǒng)計(jì)條數(shù)wc
新冠感染死亡患者的肺部單細(xì)胞圖譜Python全流程
1 數(shù)據(jù)讀取 scanpy讀取csv文件 批量讀取csv文件 單純的表達(dá)矩陣
#?導(dǎo)入包，注意dir路徑改成自己的 import?scanpy?as?sc dir?=?'/path/data/GSE171524/GSE171524_RAW/'
?#?讀取數(shù)據(jù)
adata?=?sc.read_csv(dir?+?'GSM5226574_C51ctr_raw_counts.csv').T
adata
我這么操作就會失敗? ?因?yàn)樯倭艘粋€(gè)斜杠！??！
除非?adata = sc.read_csv( 'GSM5226574_C51ctr_raw_counts.csv')
1,1 adata數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
1.2 Linux中pip 太慢Linux pip安裝速度慢（超時(shí)報(bào)錯(cuò)），為pip換源
如何徹底解決pip install慢的問題 | 《Linux就該這么學(xué)》 (linuxprobe.com)
win+R ?輸入 cmd ? 再輸入 pip install requests
@youngleel 這是因?yàn)槟愕木W(wǎng)絡(luò)跟國外的網(wǎng)絡(luò)連接不穩(wěn)定，你先輸入pip config set global.index-url https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple ?直接復(fù)制進(jìn)去回車 ?別寫錯(cuò)了 ?
pip install PySimpleGUI -i ?https://pypi.douban.com/simple/? 這個(gè)pip install 速度很快
liunx系統(tǒng)
vim ~/.pip/pip.conf [global] index-url = https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
window系統(tǒng)
在user目錄中創(chuàng)建一個(gè)pip目錄，如：C:\Users\pip，新建文件pip.ini，添加一下內(nèi)容
[global] index-url = https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
1.3 安裝scvi DeprecationWarning: scvi is deprecated, please uninstall scvi via `pip uninstall scvi` and install the new scvi-tools package at github.com/YosefLab/scvi-tools? ?
scverse/scvi-tools: Deep probabilistic analysis of single-cell omics data (github.com)
?module 'scvi' has no attribute 'model
pip install scvi-tools -i https://pypi.douban.com/simple/
1.4 you may need to restart the kernel to use updated packages? 把python關(guān)掉 重新進(jìn)入就ok了
(975條消息) you may need to restart the kernel to use updated packages如何解決-編程語言-CSDN問答
?2 doubletfinder 雙細(xì)胞過濾?Doublet過濾
# pip install scvi-tools
import scvi
# 過濾低表達(dá)基因以及高變基因選擇
sc.pp.filter_genes(adata, min_cells = 10)
sc.pp.highly_variable_genes(adata, n_top_genes = 2000, subset = True, flavor = 'seurat_v3')
# 訓(xùn)練模型
scvi.model.SCVI.setup_anndata(adata)
vae = scvi.model.SCVI(adata)
vae.train()
?python中的list有多少個(gè)不同的元素 列表中相同元素的數(shù)量?python中的list有多少個(gè)相同的元素?(975條消息) 17_NumPy數(shù)組ndarray中計(jì)算滿足條件的元素的個(gè)數(shù)_餃子大人的博客-CSDN博客_numpy計(jì)算元素個(gè)數(shù)
- print ( len (set1)) #len (set1)即為列表中不同元素的數(shù)量
- lst? ------set(lst) lst.count("True")
-
for i in set(a):
… print(‘?dāng)?shù)據(jù){0}在list中的個(gè)數(shù)為：{1}’.format(i,a.count(i)))
…
數(shù)據(jù)1在list中的個(gè)數(shù)為：11
數(shù)據(jù)2在list中的個(gè)數(shù)為：6
數(shù)據(jù)3在list中的個(gè)數(shù)為：9“`?文章來源：http://www.zghlxwxcb.cn/news/detail-720168.html
(975條消息) Python學(xué)習(xí)筆記之從list中統(tǒng)計(jì)相同數(shù)字的個(gè)數(shù)_kabuto_hui的博客-CSDN博客文章來源地址http://www.zghlxwxcb.cn/news/detail-720168.html
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