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Liunx 安裝 Miniconda與Python環(huán)境

這篇具有很好參考價(jià)值的文章主要介紹了Liunx 安裝 Miniconda與Python環(huán)境。希望對大家有所幫助。如果存在錯誤或未考慮完全的地方,請大家不吝賜教,您也可以點(diǎn)擊"舉報(bào)違法"按鈕提交疑問。

在國內(nèi)從官網(wǎng)上下載安裝包會比較慢,下載最新版容易,過往版本不易尋找。生信軟件一般建議使用過往的穩(wěn)定版本,尤其是公司集群的系統(tǒng)版本低,很容易版本不匹配。推薦從清華大學(xué)的源下載。

下載

?## anaconda的官網(wǎng)地址 ?

?????https://www.anaconda.com/products/individual

## 清華源anaconda、 miniconda 的過往版本 ??????

?????https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/archive/

?????https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/

## 選擇適合自己的版本后,用wget下載

>> wget?https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh

?## ?如果網(wǎng)站證書已過期,需要增加參數(shù)--no-check-certificate下載

>>wget ?https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh --no-check-certificate安裝

按照如下命令執(zhí)行,安裝軟件。

?chmod 755 ?Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh

?sh Miniconda3-py38_4.9.2-Linux-x86_64.sh

不能像其他軟件安裝一樣,一路yes,有幾個(gè)地方需要注意。

  1. 接受軟件安裝條款

Liunx 安裝 Miniconda與Python環(huán)境

?2. 指定軟件安裝目錄
??指定在Software目錄下安裝該軟件,會自動生成Software/Miniconda文件夾,軟件內(nèi)容在此目錄下。注意,安裝前不能存在"Miniconda"文件夾,否則會報(bào)錯’directory xxx already exists’,切記。

Liunx 安裝 Miniconda與Python環(huán)境

?3.拒絕把conda加入環(huán)境變量

????????不將conda加入.bashrc 不會影響 后續(xù)的使用,后續(xù)決定權(quán)在你且問題可控。如果每個(gè)人都默認(rèn)加入,每次登陸時(shí)會默認(rèn)激活conda的base環(huán)境,這會導(dǎo)致集群登錄很卡。如果之前有安裝conda,且將大量的軟件直接安裝在conda的base環(huán)境 或者 賬號是公用賬號,可能會把你 原來設(shè)置好的環(huán)境改變,影響部分軟件、腳本的正常運(yùn)行,得不償失。

Liunx 安裝 Miniconda與Python環(huán)境

?啟動conda

??激活conda,進(jìn)入自帶的base基礎(chǔ)環(huán)

## 激活conda,進(jìn)入base環(huán)境? ?source activate

## 如果無法執(zhí)行,可以考慮修改Miniconda/bin/activate的權(quán)限為755

## 如果還不能激活 source ?~/.bashrc? ? ?后在conda activate env_name

## 查看conda的安裝路徑

????????which conda

## 推出base環(huán)境

???conda deactivate

創(chuàng)建虛擬環(huán)境及安裝對應(yīng)應(yīng)用包

conda create -n your_env_name python=x.x????例:conda create --name py27 python=2.7

進(jìn)入環(huán)境: conda activate py27

安裝包:pip install 包名 ???例: pip install pymysql

注意安裝mysqlDB時(shí)無法安裝,用 conda install mysql-python進(jìn)行安裝即可文章來源地址http://www.zghlxwxcb.cn/news/detail-480292.html

到了這里,關(guān)于Liunx 安裝 Miniconda與Python環(huán)境的文章就介紹完了。如果您還想了解更多內(nèi)容,請?jiān)谟疑辖撬阉鱐OY模板網(wǎng)以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章,希望大家以后多多支持TOY模板網(wǎng)!

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